Là chương trình nhà trường được đội ngũ chuyên gia các môn học phát triển thành chương trình Nhà trường với những định hướng và dạy học trải nghiệm, dạy học phân hoá, dạy học kiến tạo trong mỗi chủ đề/bài học. Chương trình các môn học vừa đảm bảo thực hiện theo đúng yêu cầu của Bộ Giáo dục và Đào tạo nhưng đồng thời lại mang màu sắc đặc trưng riêng biệt của Happy School.

Các chương trình giáo dục trải nghiệm tại Happy School được thiết kế đa dạng để tạo cơ hội cho học sinh được học tập dựa trên những kinh nghiệm và trải nghiệm cá nhân cũng như tạo cơ hội cho học sinh khám phá và phát triển tiềm năng cá nhân, khắc phục những điểm yếu để không ngừng hoàn thiện mỗi ngày.

Các chương trình rèn luyện kĩ năng được phát triển thông qua môn Giáo dục cảm xúc xã hội (SEL), hoạt động sinh hoạt lớp, hoạt động giáo dục khác trong trường giúp học sinh phát triển các kĩ năng của công dân thế kỉ 21, để sẵn sàng cho việc học tập và làm việc trong một thế giới không ngừng biến động.

Là chương trình đáp ứng được chuẩn đầu ra về ngôn ngữ theo chuẩn CEFR tuỳ theo từng cấp học nhằm giúp học sinh có năng lực ngôn ngữ để sẵn sàng cho việc trở thành công dân toàn cầu với năng lực ngôn ngữ đạt chuẩn quốc tế. Happy School phát triển các chương trình học thuật dạy bằng Tiếng Anh theo chuẩn Common Core Standard của Hoa Kỳ và chuẩn Cambridge của Anh đáp ứng được nhu cầu và mục tiêu đa dạng của học sinh và phụ huynh.

Chương trình câu lạc bộ tạo cơ hội cho học sinh khám phá và trải nghiệm những lĩnh vực mới hoặc phát triển sâu hơn những nội dung được học trong các giờ học. Chương trình chính khoá và các hoạt đồng câu lạc bộ kết hợp lại sẽ tạo môi trường tốt nhất cho mỗi cá nhân